Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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