Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrprbP47758 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms