Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cdkn1bP46414 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms