Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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