Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sftpa1P35242 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms