Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VtnP29788 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VtnP29788 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VtnP29788 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VtnP29788 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VtnP29788 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
VtnP29788 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VtnP29788 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VtnP29788 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
VtnP29788 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VtnP29788 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VtnP29788 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VtnP29788 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VtnP29788 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms