Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcdP28867 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcdP28867 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcdP28867 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcdP28867 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PrkcdP28867 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
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