Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pde6aP27664 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Pde6aP27664 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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