Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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