Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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