Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkchP23298 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkchP23298 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkchP23298 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkchP23298 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkchP23298 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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