Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pou3f1P21952 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms