Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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