Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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