Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VimP20152 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VimP20152 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
VimP20152 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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