Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P20040 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P20040 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P20040 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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