Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifrd1P19182 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms