Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sptan1P16546 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sptan1P16546 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms