Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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RhoP15409 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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RhoP15409 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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RhoP15409 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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RhoP15409 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RhoP15409 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms