Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb2P13373 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms