Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H2-Ab1P01921 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
H2-Ab1P01921 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H2-Ab1P01921 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
H2-Ab1P01921 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
H2-Ab1P01921 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H2-Ab1P01921 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H2-Ab1P01921 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
H2-Ab1P01921 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H2-Ab1P01921 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
H2-Ab1P01921 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H2-Ab1P01921 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H2-Ab1P01921 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
H2-Ab1P01921 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H2-Ab1P01921 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2-Ab1P01921 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H2-Ab1P01921 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms