Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ccl20O89093 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ccl20O89093 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ccl20O89093 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ccl20O89093 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ccl20O89093 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ccl20O89093 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ccl20O89093 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Ccl20O89093 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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