Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms