Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ChkaO54804 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChkaO54804 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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