Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DffaO54786 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
DffaO54786 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
DffaO54786 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
DffaO54786 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
DffaO54786 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
DffaO54786 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
DffaO54786 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
DffaO54786 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
DffaO54786 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
DffaO54786 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
DffaO54786 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DffaO54786 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
DffaO54786 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DffaO54786 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
DffaO54786 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DffaO54786 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DffaO54786 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
DffaO54786 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DffaO54786 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
DffaO54786 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DffaO54786 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DffaO54786 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DffaO54786 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
DffaO54786 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
DffaO54786 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
DffaO54786 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DffaO54786 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DffaO54786 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DffaO54786 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
DffaO54786 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DffaO54786 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DffaO54786 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DffaO54786 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DffaO54786 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DffaO54786 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
DffaO54786 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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