Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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