Protein–RNA interactions for Protein: O08852

Pkd1, Polycystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 4,293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1O08852 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Gpatch1-201ENSMUST00000079693 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Gm7790-201ENSMUST00000118716 1310 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Gm15570-201ENSMUST00000122093 625 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Olfr333-ps1-201ENSMUST00000122311 940 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Fam240a-201ENSMUST00000177678 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Pkd1O08852 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Rpl7a-ps11-201ENSMUST00000118791 801 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Pkd1O08852 Gm26611-201ENSMUST00000181449 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Pkd1O08852 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Rps27-202ENSMUST00000195998 458 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Rce1-203ENSMUST00000224707 1255 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Pkd1O08852 Igsf5-201ENSMUST00000000163 1851 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Pkd1O08852 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Pkd1O08852 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Gm12481-201ENSMUST00000102482 297 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Gm14630-201ENSMUST00000118057 246 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Gm15727-201ENSMUST00000122416 437 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Gm23479-201ENSMUST00000158876 122 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Gm44658-201ENSMUST00000207965 637 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Gm31497-201ENSMUST00000216981 638 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pkd1O08852 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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