Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm20878L7N244 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm20878L7N244 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm20878L7N244 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm20878L7N244 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm20878L7N244 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm20878L7N244 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm20878L7N244 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm20878L7N244 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm20878L7N244 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm20878L7N244 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm20878L7N244 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
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