Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms