Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20828J3KMI7 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms