Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms