Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms