Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm28048F7BCN0 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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