Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp988F6VKC7 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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