Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Gm17541-201ENSMUST00000080062 525 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Gm18391-201ENSMUST00000217189 658 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chd2E9PZM4 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms