Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Stat1-205ENSMUST00000186574 2834 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Kirrel3-205ENSMUST00000187182 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Tcf7l2-208ENSMUST00000111654 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Kirrel3-208ENSMUST00000188933 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm42826-201ENSMUST00000197548 2639 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm19967-201ENSMUST00000179676 2138 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Lrba-206ENSMUST00000195524 3322 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm38123-201ENSMUST00000194990 2779 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102 ms