Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms