Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
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Phf11bB4XVQ1 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Phf11bB4XVQ1 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Phf11bB4XVQ1 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms