Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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PtprbB2RU80 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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