Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Brpf1B2RRD7 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Brpf1B2RRD7 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Brpf1B2RRD7 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Brpf1B2RRD7 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Brpf1B2RRD7 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Brpf1B2RRD7 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Brpf1B2RRD7 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Gm5082-203ENSMUST00000221920 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Brpf1B2RRD7 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Brpf1B2RRD7 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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