Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Col4a6B1AVK5 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Col4a6B1AVK5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Col4a6B1AVK5 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Col4a6B1AVK5 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Col4a6B1AVK5 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Col4a6B1AVK5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Col4a6B1AVK5 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Col4a6B1AVK5 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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