Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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