Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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Atp8b5A3FIN4 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Atp8b5A3FIN4 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Atp8b5A3FIN4 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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