Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Prdm16A2A935 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Prdm16A2A935 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Prdm16A2A935 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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