Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prdm2A2A7B5 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prdm2A2A7B5 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prdm2A2A7B5 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prdm2A2A7B5 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prdm2A2A7B5 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prdm2A2A7B5 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prdm2A2A7B5 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prdm2A2A7B5 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prdm2A2A7B5 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prdm2A2A7B5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prdm2A2A7B5 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prdm2A2A7B5 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prdm2A2A7B5 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms