Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ubl3Q9Z2M6 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ubl3Q9Z2M6 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ubl3Q9Z2M6 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ubl3Q9Z2M6 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ubl3Q9Z2M6 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ubl3Q9Z2M6 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ubl3Q9Z2M6 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms