Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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