Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Prg4Q9JM99 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prg4Q9JM99 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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