Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Scamp5Q9JKD3 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.3 ms