Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms